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SNPs found in the position P013

The numbers in the top row is the position in the expected PCR fragment amplified in silico from the publicly available D. melanogaster genome sequence (ST). You can see it by clicking each gene symbol in the previous table. Colored cells show nucleotides different from the ST sequence. Red: fixed SNPs (G, A, T or C) for each strain. Pink: polymorphic SNPs. Gray: Not determined (N).

Strain 99 100 135 184 201 215 222 225 228 261 273 291 321 324 339 341 351 375 396 414 417 456 486 500 510 521 528 535 540 559 580 598 599 615 623 627 630 632 636 648 649 665 702 711 722 723 738 739 756 762 771
ST G C C G G G T A G C C A G C T C G A G G G T G G T A C G T G G A A G T T T G A C G G T A G T C T G C A
S01 G C C G G G T A G C C A S C T C G A R N R T G G N N C G T S S M A G G T T G A C S R T A G K 　 　 　 　 　
S02 G C C G G G T A G C C A S C T C G A R N R T G G N R C G T S S A A G G T T G A C S R T A G K 　 　 　 　 　
S03 G C C G K N T A G C C A S C T C G A R R S T G R N 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S04 G C C G N G G N G C C C S C T T G A G R N T G S N R C G T S S A A G G T T G W C S R 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S05 G C C R K R G N R C C 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S06 G C C G N G T A G C C A S C T C G G R R S T G S N K C G T S N 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S07 G C C G G G T A G C C A S C T C G G R N N T G N N N C G T S S A A R G T W R A C S G T A G K 　 　 　 　 　
S08 G C C G K G T A G C C A S C T C G A R R S T G S N A C G W R S A A G N T W G A M S R 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S09 G C C G G G T A G C C A S C T C G A R N R T G G N A C G N R S A A R T T N R A C S B H A G D C T G C A
S10 G C C G N G T A G C C A S C T C G N R R N T G S N R C G W S S A W R G T W G A 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S11 G C C G G G T A G C C A B C T C G A R S G T G G N A C G T R G A A G T T T G A C B N T A G K C T G C A
S12 G C C G G G T A G C C A S C T C G A R G R T G G N A C G W N S A A G T T W G A C S N T A G K C T G 　 　
S13 G C C G N G G N G C C C S C T T G A R N R T G G N R C G T S S A A G G T T G W C S R 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S14 G C C G G G G N G C C C S C T T G A R R R T G G N R C G T S S A A R G T W R A C S G T A G K 　 　 　 　 　
S15 G C C G G G G N G C C C S C T T G A R R N T G N N R C G T S S A A R G T W R A C S G T A G K N W G 　 　
S16 G C C G K G T A G C C A S C T T G G R R S T G S N R C G T S S 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S17 G C C G G G T A G C C A S C T C G G R N R T G N N R C G T S S A W R G T W G W C S V Y N S W 　 　 　 　 　
S18 G C C G K R T A G C C A S C T C G A R R S T G R N 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S19 G C C G K R T A G C C A S C T C G A R R S 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S20 G C C G K N T A G C C A S C T C G A R R S T G N N A C G W R S A A G N T W G A M S R 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S21 R C C R K R G N R C 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S22 G C C G N G G N G C C C S C T T G A R R R T G N N R C G T S S A A R 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S23 G C C G N G T A G C C A S C T C G A R R R T G G N A C G W R S A A G T T W G A N S R T 　 　 　 　 　 　 　 　
S24 G C C G K R T A G C C A S C T T G G R R S T G S N 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S25 G C C G N G T A G C C A S C T C G A R N R T G G N A C G W R N A A R T N K R A C N K 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S26 G C C G N G T A G C C A S C T C G A R R R T G G N A C G W R S A A G T T W G A N S R T A G K 　 　 　 　 　
S27 G C C G G G T A G C C A S C T C G A R G V T G G N A C G T N S A A G T T W G A C S N T A G K C T G 　 　
S28 G C C G G G T A G C C A S C T C G A R G R T G G N A C G T S S A A G T T K G A C S G T A G K C T G C M
S29 G C C G G G T A G C C A S C T C G A G G R T G G N A C G W R S A A G T T W G A C S R T A G K 　 　 　 　 　
S30 G C C G G G T A G C C A S C T C G A R S V T G G N A C G N R S A A R T T K R A C S N W A G K C T 　 　 　
S31 G C C G G G T A G C C A S C T C G A R G V T G G N A C G T S S A A G T T K R A C S G T A G K C T 　 　 　
S32 G C C N K R T A G C C A S C T C G A R R S 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S33 A C C G G G G T G C C C S G G T A G R G R T G G G G T G A S G H G G G T G G G C B G C G G K T G N A G
S34 A G A G G G G T G C C C C G G T A G R G G A G G G R T G T S S T K G G T K G G C S G C G G K K G A A N
S35 A G A G G G G T G C C C C G G T A G G G G A G G G G T G T G G T G G G T T G G C G G C G G T T G A A G
S36 A G A G G G G T G C C C C G G T A G R G R A G G G R T G T S S T K G G T N G G C S G M G G K K G 　 　 　
S37 A C C G N G G T G T C C S G G T A G R N R T A N G K T G A S S Y K G G T G R K C N R 　 　 　 　 　 　 　 　 　
S38 A G C G G G G T G C C C S G G T A G R G R A G G N R T T T S S T K G G G K G A N G G C G G K K G 　 　 　
S39 A G C G G G G T G C C C B G G T A G R G G A G G N G T T T S G T G G G G B G A W G G C G G T T G S C S
S40 A C A G N G G T G C C C K G G T A K N R A T G R G S T K A R N 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　

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