D. ananassaeとその近縁種の標準系統、突然変異系統５１系統の１９遺伝子座（１１遺伝子座／X染色体、８遺伝子座／第2染色体）に関するSNP情報

方法

Assembly/Alignment/Annotation of 12 related Drosophila species⁽¹⁾上のD.ananassae ゲノム配列をreferenceとして、 novoSNP⁽²⁾により各系統のSNPを検索して、国際表記に従い遺伝子座毎にエクセルファイルでまとめた。

	chromo. arm	CG
XL (5)	sn	CG32858
	Marf	CG3869
	Actn	CG4376
	zw	CG12529
	v	CG6976
XR (6)	fw	CG1500
	f	CG5424
	Bx	CG6500
	w	CG2759
	N	CG3936
	Yp2	CG2979
2L (8)	CG2604	CG2604
	Su(var)3-7	CG8599
	ca	CG31037
	spn-A	CG7948
	Antp	CG1028
	CG31232	CG31232
	Dl	CG3619
	CG2017	CG2017

参考

(1) http://rana.lbl.gov/drosophila/ananassae.html
(2) Weckx, S., Del-Favero, J., Rademaker, R., Claes, L., Cruts, M., De Jonghe, P., Van Broeckhove, C., & De Rijk, P., 2005. novoSNP, a novel computational tool for sequence variation discovery. Genome Research 15: 436-442.